1999年派佩獲得了兩項(xiàng)全英音樂獎(jiǎng)提名，而在獲得《Smash Hits》最佳女歌手的頒獎(jiǎng)晚會(huì)上她卻被時(shí)任男友的Ritchie Neville（男孩團(tuán)體FIVE成員）坐在臺(tái)下的粉絲們噓至留下眼淚。一年后，派佩以全名“比莉·派佩”和更加成熟的聲音、形象發(fā)表了第二張專輯，專輯首支單曲《Day & Night》擁有強(qiáng)勁有力的樂聲和震耳欲聾的節(jié)奏，一推出就拿下了她個(gè)人第二支冠軍單曲，讓派佩擊敗小甜甜布蘭妮而成為英國擁有兩支冠軍曲的最年輕女藝人，然而這樣的成功卻沒能繼續(xù)持續(xù)下去，期間厭食、吸毒，專輯銷量不佳帶來的抑郁甚至是自殺以及被變態(tài)跟蹤者騷擾等各種負(fù)面報(bào)道也一直困擾著她。
2005年開播的新版經(jīng)典科幻劇集《神秘博士》中派佩得到了博士的旅行伙伴羅斯的角色，先后同兩任博士扮演者克里斯托弗·?？巳R斯頓和大衛(wèi)·田納特合作。這次演出相當(dāng)成功，為她贏得了05和06連續(xù)兩年的國家電視獎(jiǎng)的最受歡迎女演員獎(jiǎng)以及被BBC新聞成為05年的“年度面孔”之一，成功實(shí)現(xiàn)從偶像歌手到演員的轉(zhuǎn)型。盡管比莉·派佩一年前就做出了離開《神秘博士》的決定，但直到06年6月這一消息才被BBC公開。她原本還有希望主演一檔以離開的博士羅斯為主角的衍生劇集，但是由于博士系列的衍生劇過多而未能成行。2005年派佩出演了莎劇改編的BBC電視電影《無事生非》，這一現(xiàn)代版戲說中她扮演的Hero是電視臺(tái)的一位天氣預(yù)報(bào)員。
